Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms