Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms