Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc4Q9D844 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc4Q9D844 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms