Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms