Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp5Q9D7S9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms