Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmigd1Q9D7L8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms