Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop56Q9D6Z1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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