Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc3Q9D6Y1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms