Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Borcs6Q9D6W8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Borcs6Q9D6W8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms