Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ptp4a3Q9D658 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptp4a3Q9D658 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptp4a3Q9D658 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms