Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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