Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms