Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrameQ9D4Z5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrameQ9D4Z5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms