Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D4W2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D4W2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D4W2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms