Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms