Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcc1Q9D4H2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms