Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1Q9D495 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms