Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UvssaQ9D479 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UvssaQ9D479 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms