Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms