Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms