Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms