Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6bQ9D289 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms