Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms