Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl53Q9D1H8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms