Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1lQ9D1E5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms