Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms