Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem53Q9D0Z3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms