Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arv1Q9D0U9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arv1Q9D0U9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms