Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm12Q9D0R8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms