Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mdm1Q9D067 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mdm1Q9D067 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms