Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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