Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYT6

Cap2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap2Q9CYT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cap2Q9CYT6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cap2Q9CYT6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cap2Q9CYT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms