Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrs1Q9CYH6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms