Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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