Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Exo5Q9CXP9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms