Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nip7Q9CXK8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms