Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms