Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms