Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sugt1Q9CX34 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms