Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnih4Q9CX13 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih4Q9CX13 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnih4Q9CX13 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms