Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx10Q9CWT3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms