Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms