Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms