Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms