Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms