Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufab1Q9CR21 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms