Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Polr3kQ9CQZ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Polr3kQ9CQZ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms