Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms