Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2Q9CQP2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms