Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Txndc17Q9CQM5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txndc17Q9CQM5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms